Resumo. A crescente competitividade por recursos destinados ao financiamento da pesquisa científica exige métodos estruturados e transparentes para a seleção de projetos de alto impacto. No campo dos transportes logísticos, em que decisões envolvem múltiplas variáveis técnicas, econômicas e estratégicas, a adoção de modelos quantitativos torna-se essencial. Nesse contexto, a Programação Linear Binária (PLB) destaca-se por permitir a modelagem de decisões discretas, representando a seleção ou rejeição de alternativas sob restrições previamente definidas. O presente estudo tem como objetivo analisar a aplicação da PLB na seleção de projetos de pesquisa em transportes logísticos, propondo um modelo matemático orientado à maximização do retorno científico e institucional. A metodologia baseia-se em revisão bibliográfica e formulação de modelo determinístico com variáveis binárias. Os resultados demonstram que a PLB proporciona maior racionalidade, transparência e eficiência na alocação de recursos escassos. Conclui-se que a ferramenta apresenta elevado potencial de aplicação em universidades, centros de pesquisa e agências de fomento.