Resumo. A avaliação da diversidade genética pode fornecer informações valiosas para programas de conservação e melhoramento genético, visando maximizar a expressão de características de interesse na produção. Nesse contexto, o cupuaçuzeiro (Theobroma grandiflorum Malvaceae) se destaca por ser uma árvore nativa da Amazônia e ter, seu fruto, o cupuaçu, amplamente utilizado na produção e comercialização de diversos alimentos. Assim, o objetivo do estudo foi analisar os parâmetros genéticos e a dissimilaridade entre as progênies conservadas ex situ no município de Marabá, estado do Pará, Brasil. O delineamento experimental consistiu em 200 genótipos distribuídos em blocos ao acaso, considerando uma planta por parcela. Os genótipos são procedentes de 10 progênies, com sementes oriundas de polinização livre. A partir dos caracteres silviculturais e morfológicos das folhas foram estimados parâmetros genéticos e medidas de dissimilaridade. As estimativas das variâncias resultaram em altas herdabilidades individuais, com todos os caracteres apresentando valores superiores a 0,80. As estimativas de acurácia para todos os caracteres foram superiores a 0,90, proporcionando alta precisão em uma possível seleção. Os resultados da análise multivariada sugerem que o diâmetro do coleto mais contribuiu para explicar a variação total do material analisado. O método de agrupamento de Tocher a partir das distâncias genéticas de Mahalanobis, constituiu oito grupos de dissimilaridade, demonstrando diversidade genética para os caracteres observados. Há diversidade genética nas progênies analisadas, com potencial para a conservação genética e seleção, baseada nos caracteres observados.